癌细胞的高功能异质性对癌症研究构成了重大挑战。单细胞测序技术提供了以单细胞分辨率破译癌细胞的多种功能状态的前所未有的机会，并且癌症scRNA-seq数据集已经在很大程度上积累。这强调迫切需要建立专用资源来解码癌症单细胞的功能状态。
下面，我们来介绍一个数据库，它是第一个用于在单细胞水平上全面探索癌细胞功能状态的专用数据库---CancerSEA：a cancer single-cell state atlas
在具体使用上，先来看下数据库的搜索功能，该数据库可通过基因和功能状态进行搜索，我们首先介绍下基因的搜索：
在基因搜索方面我们可以使用单个基因或者基因列表两种方式进行搜索，这里可以选择我们想要搜索的癌症类型以及功能状态：
我们以搜索SOX4基因为例，单击“搜索”按钮后，将显示包含四个部分的查询结果。第一部分“输入基因的基本信息（列表）”显示了感兴趣基因的基本注释，包括基因符号，别名，Ensembl ID，功能描述和外部链接，包括Entrez Gene数据库和Ensemble数据库。
当点击基因的“基因符号/ ID”时，将显示表征基因在其表达的所有数据集中的表达模式的箱形图。
我们还会得到不同癌症中14种功能状态的相关性，它包含两部分，第一部分“相关图”显示了不同基因表达与不同单细胞数据集中每种功能状态活动之间的平均相关性。它可以快速，清晰地指出哪些功能状态最相关。当点击特定功能状态的条时，将突出显示在相应癌症类型中的至少一个数据集中具有显著相关性的气泡。
将鼠标放在突出显示的气泡上时，将弹出每个数据集中的详细信息（包括相关值和相应的p值），这会通知用户哪些数据集是“重要数据集”。
在第三部分中，我们可以了解有关特定癌症功能相关性的更多深入信息。我们通过在第二部分的气泡图左侧单击癌症类型，结果表用于显示所有单细胞数据集的基本信息。所选择的癌症类型以及与14种功能状态的相应相关性。
最后一部分“不同细胞群中的功能相关性”通过单击不同的数据集选项来显示特定数据集的每个特定细胞群中的详细功能相关性。 它还包含显示输入基因在该选定数据集中的表达分布的箱式图和所有单个细胞的t-SNE图，其中颜色代表输入基因的表达水平。
同理，我们可以通过向数据库中输入基因列表来查询基因列表的平均表达水平与功能状态之间的相关性。
在“主页”页面中，我们可以单击嵌入在单元树图像“不同状态的癌细胞”中的“状态”超链接和右上方窗口中的“功能状态”面板。
这里我们以“metastasis”为例，点击之后在结果页面中，第一个面板显示不同癌症类型的所选功能状态的活动概况，第二个面板允许用户浏览和下载经常与不同癌症类型的状态显著相关的PCG / lncRNA的所有组成成分。
我们以乳腺癌为例，单击Breast cancer来浏览乳腺癌的功能状态概况，图中列出了乳腺癌中所有数据集的状态活动的分层聚类热图。
此外，我们通过单击菜单中的数据集名称，可以选择感兴趣的数据集以进一步浏览详细信息，包括“详细描述”，“功能状态配置文件”，“细胞分布”，“PCG/lncRNAs的表达
此数据库的主页面还包含“statistic”选项，主要是对数据库的内容进行了统计，包括所有实验的癌症类型比例，QC前后每种癌症中单细胞的数量，每种癌症中细胞群的比例，QC后每种癌症中单细胞的比例。
最后就是下载了，CancerSEA中的所有数据都可以在“下载”页面下载，其中包含每个单细胞数据集的功能状态配置文件和PCG / lncRNA表达谱以及功能状态标签。蒋梦婕天天向上