乌鲁木齐市新型农牧区合作医疗管理办公室承担着乌鲁木齐市、乌鲁木齐县、米东区新农合结算管理工作。为解决我市新农合无标准数据库机房，改善数据库与安全，适应新农合日益发展的需要，市卫生局、市农合办决定，将市农合办三套数据库搬迁到乌鲁木齐市区域卫生信息平台。
乌鲁木齐市区域卫生信息平台设在市血液中心办公楼，于2013年3月完成机房验收、服务器、网络设备的安装调试。5月27-29日迁移期间所有医疗机构农合业务系统停止，停机时间为72小时。此之前市农合办要求各医疗机构在5月25日前做好扎帐工作，并在医院明显位子患者通知。5月29日各医疗机构陆续调通网络，进行新农合业务系统使用测试，并顺利恢复使用新农合系统结算。