MySQL与PostgreSQL都能运行在多个操作系统上，如Linux、Unix、Mac OS X与Windows。他们都是开源、免费的，因此测试他们时的唯一代价就是你的时间与硬件。他们都很灵活且具有可伸缩性，可用在小型系统和大型分布式系统上。MySQL在一个领域上要比PostgreSQL更进一步，那就是它的触角延伸到了嵌入式领域，这是通过libmysqld实现的。PostgreSQL不支持嵌入式应用，依然坚守在传统的客户端/服务器架构上。
MySQL通常被认为是针对网站与应用的快速数据库后端，能够进行快速的读取和大量的查询操作，不过在复杂特性与数据完整性检查方面不太尽如人意。PostgreSQL是针对事务型企业应用的严肃、功能完善的数据库，支持强ACID特性和很多数据完整性检查。他们二者都在某些任务上具有很快的速度，MySQL不同存储引擎的行为有较大差别。MyISAM引擎是最快的，因为它只执行很少的数据完整性检查，适合于后端读操作较多的站点，不过对于包含数据的读/写数据库来说就是个灾难了，因为MyISAM表最终可能会损坏。MySQL提供了修复MySQL表的工具，不过对于数据来说，支持ACID特性的InnoDB则是个更好的选择。
与之相反，PostgreSQL则是个只有单一存储引擎的完全集成的数据库。你可以通过调整postgresql.conf文件的参数来改进性能，也可以调整查询与事务。PostgreSQL文档对于性能调优提供了非常详尽的介绍。
MySQL与PostgreSQL都是高可配置的，并且可以针对不同的任务进行相应的优化。他们都支持通过扩展来添加额外的功能。
一个常见的就是MySQL要比PostgreSQL更容易学习。关系数据库系统都常复杂的，这两个数据库的学习曲线其实是差不多的。
标准兼容性
PostgreSQL旨在实现SQL兼容性（当前标准是ANSI-SQL:2008）。MySQL则兼容大部分SQL，不过还有自己的扩展，可以支持NoSQL特性，这在参考手册中都有介绍。每种方式都有优缺点。兼容标准会让数据库管理员、数据库开发者与应用开发者更舒服一些，因为这意味着他们只需学习一套标准、一套特性和命令即可。这会节省时间，提升效率，也不会被锁定在特定的厂商上。
支持使用非标准的自定义功能的人们认为这样可以快速采用新的特性，而不必等待标准进程完成。ANSI/ISO标准在不断演化，因此标准兼容性也是个变化的目标：知名的关系型数据库Microsoft SQL Server、Oracle与IBM DB2也只是部分兼容于标准。
结论
虽然有不同的历史、引擎与工具，不过并没有明确的参考能够表明这两个数据库哪一个能够适用于所有情况。很多组织喜欢使用PostgreSQL，因为它的可靠性好，在数据方面很擅长，而且是个社区项目，不会陷入厂商的之中。MySQL更加灵活，提供了更多选项来针对不同的任务进行裁剪。很多时候，对于一个组织来说，对某个软件使用的熟练程度要比特性上的原因更重要。
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