PubMed 是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学，但亦包括其他与医学相关的领域，像是护理学或者其他健康学科。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的支援，像是生化学与细胞生物学。这搜寻引擎是由美国国立医学图书馆提供，作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的连结。
PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。PubMed界面提供与综合生物学数据库的链接，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据，3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。
PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘，可与提供原文的网址链接，提供检索词自动转换匹配，操作简便、快捷。
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于查询系统。
pubmed客户端，完全免费，界面汉化，支持中文查询，能将中文与mesh词自动匹配，可免费快速获得全文。
MEDLINE收录1966年以来的包含医学、护理、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献1600万余条书目数据(2005年数据)，记录的标记为[PubMed-indexed for MEDLINE]。这些数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊，近年数据涉及30多个语种，回溯至1966年的数据涉及40多个语种，90%左右为英文文献，70%~80%的文献有著者撰写的英文摘要。
In Process Citations 1996年8月开始，每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据，该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-in process]。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时，每星期转入MedLine一次，而被处理前的数据从该数据库中删除。
2. MeSH Database：点选此功能后，在检索栏位中输入欲查询的词汇，可浏览PubMed资料库中所使用控制词汇。
3. Single Citation Matcher：使用栏位化的检索方式，找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。
4. Batch Citation Matcher：以指令式的方式批次检索资料库中相关的文献，只要输入刊名、年代、卷期、起始页、作者名、关键词其中部分栏位资料即可。
5. Clinical Queries: 临床病理资料，本功能提供临床病理资料之查询，并依Haynes RB等专家所制订的最佳化检索策略之机制，使用者可先行选择检索方向，如：治疗方式(Therapy)、诊断方式(Diagnosis)、病因(Etiology)、预后状况(Prognosis)其中的一类，并可选择预期之检索结果是较具相关性(sensitivity)或精确率(specificity)较高的。
6. LinkOut：LinkOut为PubMed提供使用者连结外部网资源之功能选项，连结内容包括国外图书馆馆藏目录、线上电子全文、书目资料库清单、消费者健康资讯、研究等资讯。如有外部资源的连结，使用者可在PubMed摘要书目中看到LinkOut此一选项。
7. 免费个人化检索服务My NCBI：在MY NCBI服务页建立个人检索帐号/密码后，即可使用个人化检索服务，该服务提供储存/删除检索结果、My LinkOut设定及文献传递等个人化服务
主题检索：在PubMed主页的检索框中键入英文单词或短语(大写或小写均可)， PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。例如：键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
著者检索：当所要查询的是著作者时，在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为“著者姓 空格 名字首字母缩写”，例如smith ja，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索结果。
日期或日期范围检索 可以在检索框中键入日期或日期范围，系统会按日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如：1999/09/08。也可以不录月份和日子，如：2000或1999/12。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物 学数据，序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
汉化，让中国的PubMed使用者尽量多的看到、使用自己更为熟悉的、美丽的中文高级检索页面进行了汉化。
检索结果页面集成了根据金叶天盛科技有限公司著名产品《新编全医药学大词典》制作的网络词典，对自己不熟悉的英语可以双击或鼠标选定后查看网络词典的翻译结果。
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